191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47120 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  100 
 
 		 748 aa  1538    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00100  3' tRNA processing endoribonuclease, putative  29.36 
 
 		 1037 aa  187  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0118695  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  36.94 
 
 		 447 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86123  predicted protein  35.33 
 
 		 780 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389885  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00951  putative b-zip transcription factor (Eurofung)  26.16 
 
 		 1728 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984135 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65151  predicted protein  28.66 
 
 		 871 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  29.6 
 
 		 305 aa  98.2  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 287 aa  94.7  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 306 aa  93.2  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  28.43 
 
 		 305 aa  92.8  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  29.6 
 
 		 312 aa  86.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.64 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  27.76 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  29.2 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  30.71 
 
 		 328 aa  83.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  28.32 
 
 		 307 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 291 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  27.41 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  27.49 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  26.92 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.56 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  28.35 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  25.33 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  28.42 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.84 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  29.5 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  29.5 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.01 
 
 		 327 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  27.34 
 
 		 306 aa  76.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.41 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  26.88 
 
 		 307 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  27.54 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.47 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.74 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.4 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.52 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  28.28 
 
 		 312 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.76 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  26.29 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.76 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  27.34 
 
 		 306 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  27.34 
 
 		 306 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  29.24 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.19 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 316 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  28.01 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.56 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  26.5 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  27.66 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  25.54 
 
 		 304 aa  67  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  25.77 
 
 		 323 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.48 
 
 		 326 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  25.63 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  25.61 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  23.08 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 235 aa  63.9  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.81 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.74 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.45 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 262 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.86 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.43 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  22.86 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  29.15 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.86 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  26.13 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  27.5 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  28.27 
 
 		 307 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>