279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1765 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  68.09 
 
 		 235 aa  353  1e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  70.82 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  63.95 
 
 		 235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  40.25 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  37.13 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.07 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.22 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.3 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.03 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  30.06 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  28.02 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  27.98 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  27.98 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  27.98 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  27.52 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  25.74 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  27.98 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  26.84 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  27.06 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  27.93 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.89 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.11 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  26.91 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  27.52 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.04 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.47 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.6 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  24.53 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  26.58 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  34.53 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.56 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  26.05 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.83 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.75 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  27.97 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  27.57 
 
 		 748 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.05 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  25.79 
 
 		 287 aa  62  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.15 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.15 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.32 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  26.38 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  29.52 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  26.37 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  25.45 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.46 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.02 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.75 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.87 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>