177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2634 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 252 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  92.46 
 
 		 252 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  62.3 
 
 		 252 aa  329  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  55.73 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  41.8 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.04 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  43.5 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  39.67 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  38.35 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  40.51 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.13 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.23 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  32.82 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.13 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.39 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 		 796 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.23 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  32.23 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  31.82 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  32.09 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.74 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.52 
 
 		 339 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.24 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.24 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.24 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.34 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  28.3 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  28.41 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.08 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.96 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.54 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.75 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.92 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.4 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  27.31 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  25.86 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  24.46 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.26 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2120  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.18 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.55 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.2 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  26.56 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  28.04 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  31.93 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.91 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  25 
 
 		 285 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.51 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  24.88 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  27.98 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  24.27 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.46 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  24.47 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.81 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  26.92 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.3 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  23.61 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>