31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1916 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  675    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  92.35 
 
 
327 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  49.39 
 
 
331 aa  325  7e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.85 
 
 
319 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  40 
 
 
330 aa  232  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.67 
 
 
329 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.76 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.71 
 
 
345 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.71 
 
 
345 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.69 
 
 
339 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.39 
 
 
345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.23 
 
 
326 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  28.17 
 
 
384 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  25.24 
 
 
561 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  27.3 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
252 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.59 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  25 
 
 
255 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 
255 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05390  cAMP-specific phosphodiesterase, putative  32.2 
 
 
464 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
252 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.98 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.49 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  27.18 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 
252 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.51 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 
796 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
262 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  27.35 
 
 
413 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>