30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1926 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  92.35 
 
 		 327 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  51.21 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.39 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  38.62 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.34 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.29 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.51 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.74 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  37.74 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  37.42 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.92 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  29.43 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  24.56 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  26.6 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.91 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  24.02 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05390  cAMP-specific phosphodiesterase, putative  33.63 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.51 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  25.65 
 
 		 263 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  23.18 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.53 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.31 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  23.62 
 
 		 796 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>