160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0298 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  50.43 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  46.15 
 
 		 267 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.96 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  43.88 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  43.46 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  41.15 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  42.46 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  40.8 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  35.1 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  42.35 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.39 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 796 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  29.7 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  28.95 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  27 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  29.14 
 
 		 345 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.14 
 
 		 345 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  28.78 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.36 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  25 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.24 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.91 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  26.91 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.01 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  27.59 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  28.39 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.58 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.22 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  28.07 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  28.02 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.38 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.51 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0432  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.47 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0467  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.47 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.169568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  32.77 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  27.87 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  29.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  28.57 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  27.51 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.98 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.42 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  24.74 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.67 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  32.05 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  32.05 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  32.05 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  25.79 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.79 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.52 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  29.52 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  29.52 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  29.52 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2259  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.28 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  0.710906 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  34.55 
 
 		 561 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  27.51 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  31.16 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2297  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  26.6 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  27.07 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  27.51 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4141  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  28.04 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 821 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  30.94 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.45 
 
 		 393 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.12 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  27.51 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>