130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0893 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  59.5 
 
 		 280 aa  362  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  59.14 
 
 		 280 aa  361  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  58.57 
 
 		 279 aa  350  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  45.52 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  32.22 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0220  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  29.76 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  29.54 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  28.12 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  27.41 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  26.26 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.86 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  28.12 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  28.12 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  28.52 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.73 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  28.52 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2995  Nuz  30.04 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.234829  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  26.37 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  28.12 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  27.47 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.02 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.73 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  27.45 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.98 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  27.68 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  27.45 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  26.95 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.57 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  27.2 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.45 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  26.44 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  26.22 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.94 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  26.88 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26345  predicted protein  25.54 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.74 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  23.91 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  28.69 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.06 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  25.38 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  25.5 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  25.47 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.1 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  24.4 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.1 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  32.61 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1808  ribonuclease Z  23.6 
 
 		 354 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0346445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  24.3 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1678  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.62 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.3 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  23.57 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  24.8 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  42.62 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  24.34 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  24.56 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  24.34 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  30.3 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  23.11 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  25.98 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  34.62 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.16 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  29.2 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>