113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2725 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  100 
 
 		 290 aa  583  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26345  predicted protein  37.36 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2995  Nuz  33.33 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.234829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  30.29 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  30.29 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  30.88 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0220  hypothetical protein  29.67 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  27.89 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  26.75 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  23.5 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.66 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  27.9 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  27.9 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  37.86 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  34.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  34.78 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  23.94 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  23.39 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.33 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  29.29 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  28.28 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.52 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  33.93 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  28.05 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  28.28 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  25.36 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.17 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  27.34 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  23.9 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  37.5 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  24.8 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  21.43 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  21.88 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  29.01 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.29 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  33.68 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  34.74 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  32.74 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.38 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  28.28 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  32.32 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  29.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.21 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  23.6 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  29.31 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.52 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  27.17 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.7 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0540  Ribonuclease Z  30.82 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  24.7 
 
 		 321 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  22.7 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.09 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.64 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.35 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  21.09 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.22 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 247 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  29.57 
 
 		 310 aa  45.8  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2340  ribonuclease Z  29.05 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  32.63 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.21 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  27.73 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  24.57 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  23.13 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.91 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  27 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>