48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0220 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0220  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  605  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  51.88 
 
 		 292 aa  322  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  32.4 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  31.71 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  29.67 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2995  Nuz  29.66 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.234829  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26345  predicted protein  33.11 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  29.3 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.5 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  23.55 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  23.55 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  23.08 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.33 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  30 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  24.5 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.56 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1128  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.48 
 
 		 304 aa  49.3  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.78 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.94 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  23.68 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  25.95 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26.09 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1383  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.409103  normal  0.0217204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86123  predicted protein  28.7 
 
 		 780 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  24.62 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  27.92 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  26.78 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  32.18 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  25.76 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.3 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  39.66 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  29.17 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  23.05 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  26.62 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  25.97 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  25.21 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  23.02 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65151  predicted protein  32.08 
 
 		 871 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  37.5 
 
 		 748 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>