83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0345 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  100 
 
 		 361 aa  742    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  55.49 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  58.89 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  56.35 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  54.24 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  51.34 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  51.02 
 
 		 164 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  32.92 
 
 		 356 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  30.67 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  31.08 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  29.06 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  29.82 
 
 		 338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  28.27 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  27.88 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  30.9 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  27.73 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  29.87 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  28.4 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  29.25 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  28.45 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  27.74 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.64 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.3 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  25.24 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.05 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.7 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  22.75 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.93 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  24.52 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  23.03 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  23.96 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  22.26 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  24.68 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  22.77 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  21.71 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  21.4 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  21.4 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  21.4 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  21.74 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.21 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.14 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  21.74 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  24.14 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  24.83 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  21.15 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  24.61 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  21.97 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  22.51 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  23.8 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  23.8 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  22.51 
 
 		 307 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  23.65 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.68 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.73 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  22.33 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.49 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  23.39 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  24.57 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  22.66 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  21.29 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  21.96 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  21.9 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  21.29 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  23.15 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.83 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  34.52 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  20.97 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  20.97 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  20.97 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  20.97 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  41.67 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  22.29 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  20.97 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 249 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  20.18 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>