83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1986 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  100 
 
 		 365 aa  756    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  51.99 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  51.92 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  50.42 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  47.03 
 
 		 361 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  46.88 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  32.01 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  28.62 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  44.22 
 
 		 164 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  29.97 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  28.48 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  30.59 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  28.1 
 
 		 336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  28.16 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  29.04 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  31.13 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  29.72 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  29.97 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  28.48 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  28.61 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  26.65 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  25.16 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  22.19 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.14 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  26.25 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.39 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.47 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.69 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  23.78 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  26.74 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.62 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  23.3 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.45 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  22.18 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  22.64 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  21.86 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.64 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  22.61 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  22.61 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  21.86 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  23.53 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  21.93 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  21.16 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  23.31 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.71 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  21.69 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  21.69 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  21.69 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  22.14 
 
 		 345 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  21.69 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  22.19 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  21.69 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.34 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  23.73 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  38.03 
 
 		 316 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  20.62 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  31.4 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.62 
 
 		 314 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  22.43 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  20.63 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  20.82 
 
 		 304 aa  46.2  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 320 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  22.55 
 
 		 305 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  22.55 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  32.97 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  35.21 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  20.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.99 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  22.22 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  25.27 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  30.77 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 		 871 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1430  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 276 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.394554  normal  0.142096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>