99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1716 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  100 
 
 		 363 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  35.69 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  34.57 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  35.83 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  36.03 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  35.51 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  32.97 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  34.18 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  35.13 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  39.11 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  30.34 
 
 		 333 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  39.02 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  35.36 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  35.34 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  33.45 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  27.14 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  23.37 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  29.61 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  26.61 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  29.57 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  29.57 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  28.16 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  28.95 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  31.07 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.89 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  30.89 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  32.14 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.52 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  22.35 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  28.79 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.5 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  29.18 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  28.05 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.4 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  27.36 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  27.56 
 
 		 315 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.51 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.6 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.9 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.9 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  30.22 
 
 		 164 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  25 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  27.73 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  25.89 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  27.78 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  26.34 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  38.24 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 305 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  25.14 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.71 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  25.14 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  22.77 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1071  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.58 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  23.35 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  29.48 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25.57 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.36 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  21.05 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  25.11 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.67 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  24.62 
 
 		 307 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.63 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  27.08 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.89 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.64 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.22 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  24.62 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  25.76 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  28.37 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  26.09 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.41 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  21.21 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  24.6 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  28.37 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  23.94 
 
 		 312 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  29.37 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  25.84 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1991  ribonuclease Z  26.94 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  32.47 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4220  Ribonuclease Z  27.64 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  30.66 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>