72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0188 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  100 
 
 		 361 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  81.89 
 
 		 366 aa  594  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  58.89 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  48.03 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  47.22 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  50.46 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  54.05 
 
 		 164 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  33.03 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  30.77 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  31.69 
 
 		 338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  30.91 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  32.01 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  31.44 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  29.66 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  33.03 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  32.5 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  27.22 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  30.32 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  30.03 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  31.2 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.61 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.73 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.91 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.21 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  24.26 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  24.23 
 
 		 312 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  22.64 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  22.78 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  22.64 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  22.78 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  22.78 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.24 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.24 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.24 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.24 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.24 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.24 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.08 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  23.17 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.61 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  22.96 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  22.96 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  26.17 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  40.91 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  23.84 
 
 		 319 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  24.61 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  40.91 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  27.63 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.98 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  25.86 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  23.58 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.31 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  24.62 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.62 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  24.75 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  27.66 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  20.53 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  23.26 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.24 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  31.21 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  31.21 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  31.21 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  35.21 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  22.01 
 
 		 307 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>