68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0412 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  100 
 
 		 361 aa  747    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  93.35 
 
 		 360 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  55.49 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  44.85 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  47.22 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  47.29 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  31 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  29.85 
 
 		 356 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 338 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  32.52 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  29.38 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  30.49 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  29.39 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  29.78 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  28.83 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  28.61 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  26.65 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  30.35 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  26.03 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  40.27 
 
 		 164 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  30.56 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  22.55 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.11 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  24.83 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  23.81 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  24.02 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  23.35 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  22.62 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  23.56 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.17 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  26.21 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  26.21 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  31.07 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  21.62 
 
 		 301 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  25.16 
 
 		 312 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  24.17 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  21.92 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.17 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  26.9 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  32.99 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  25.47 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  22.64 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.4 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  24.87 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  21.82 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  21.04 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  23.79 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  26.21 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  26.9 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  36.14 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  22.52 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.79 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  25.7 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  22.52 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  24.08 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  21.93 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  29.58 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  32.05 
 
 		 308 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  31.58 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  35.21 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  31.58 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>