127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3084 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  100 
 
 		 337 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  41.81 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  43.33 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  43.45 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  43.73 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  43.67 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  40.9 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  39.88 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  38.97 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  41.32 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  38.28 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  38.39 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  38.67 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  36.28 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  28.04 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  31.17 
 
 		 365 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  30.12 
 
 		 361 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  28.97 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  28.62 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  30.46 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  29.28 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.02 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  29.3 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  30.42 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  30.06 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  28.75 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  27.56 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  28.34 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  28.75 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  34.27 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.63 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  29.34 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  28.44 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  29.34 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  28.53 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  25.55 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  29.11 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  28.83 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  27.54 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.1 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.1 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  28.13 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  29.21 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  28.7 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.44 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  28.3 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.42 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  21.43 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  27.47 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.52 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.61 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.76 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  24.48 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.55 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  23.86 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  27.36 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  27.53 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.87 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  22.65 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  27.83 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.9 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  23.2 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  24.77 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  26.33 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  27.65 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  27.65 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16162  predicted protein  26.1 
 
 		 284 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  29.59 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  27.51 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.07 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  25.08 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  29.68 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  27.71 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  27.71 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  31.01 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  27.71 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  27.71 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  27.71 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  27.71 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  27.39 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.12 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  27.62 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  27.71 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  30.11 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>