162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3742 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  100 
 
 		 335 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  47.92 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  47.26 
 
 		 351 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  47.15 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  45.13 
 
 		 356 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  47.5 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  40.79 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  40.18 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  40.95 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  41.32 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  41.14 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  41.12 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  38.76 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  38.67 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  27.74 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.71 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  29.97 
 
 		 365 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  26.98 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  31.2 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  29.02 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  30.41 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  32.21 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  30.45 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  29.41 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  27.92 
 
 		 314 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.92 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25.73 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.16 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  29.11 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  29.11 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  25.8 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  29.81 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.35 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  25.57 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.81 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  30.91 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  30.43 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.69 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  29.05 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  29.3 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  27.42 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0857  ribonuclease Z  39.53 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0914  ribonuclease Z  36.99 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.84 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  27.39 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  26.92 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  28.08 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.84 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  30.06 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  30.52 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  28.04 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  28.66 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5799  ribonuclease Z  36.84 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  27.33 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.01 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  27.21 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  24.19 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  23.41 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  24.09 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  30.31 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  30.98 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  28.71 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  26.56 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  36.72 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  28.33 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.42 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  28.33 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  28.33 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  28.66 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  24.55 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2229  ribonuclease Z  28.72 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  28.33 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  28.33 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.69 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  29.13 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  22.67 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.69 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>