114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2736 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  100 
 
 		 321 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  53.94 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  53.02 
 
 		 336 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  54.34 
 
 		 349 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  49.05 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  52.7 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  48.74 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  47.92 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  47.3 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  44.76 
 
 		 366 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  46.03 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  41.9 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  41.12 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  41.32 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  29.49 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  30.59 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  30.35 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  30.9 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.34 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  31.29 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  30.72 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  30.32 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  32.39 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  37.06 
 
 		 164 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  27.15 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  26.46 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  28.8 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  27.9 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.87 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.1 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  25.85 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  24.5 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  25.85 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  24.27 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  28.06 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.77 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.41 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.84 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  21.97 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12268  predicted protein  24.29 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  23.68 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.19 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  25.36 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  24.82 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  25.9 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.42 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.79 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.67 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  27.49 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  25.96 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  27.67 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  25.84 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  24.33 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  21.9 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  22.73 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  20.83 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  35.98 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.83 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.64 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  23.73 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  28.3 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1070  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  22.4 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.16 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  22.29 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  23.7 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.71 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  27.57 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  21.43 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  20.32 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  22.55 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  27.06 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  27.95 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  22.74 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>