71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0450 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0450  ribonuclease Z  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000909133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0345  ribonuclease Z  51.02 
 
 		 361 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00109511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0188  ribonuclease Z  54.05 
 
 		 361 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000238332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0134  ribonuclease Z  53.38 
 
 		 366 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1986  ribonuclease Z  44.22 
 
 		 365 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0412  ribonuclease Z  40.27 
 
 		 361 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0412  ribonuclease Z  40.54 
 
 		 360 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2736  ribonuclease Z  37.06 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0724  ribonuclease Z  34.87 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0722047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1038  ribonuclease Z  34.93 
 
 		 336 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3084  ribonuclease Z  34.27 
 
 		 337 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0020  ribonuclease Z  26.76 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1049  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 335 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0245  ribonuclease Z  30.82 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000981412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0229  ribonuclease Z  30.82 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1232  ribonuclease Z  31.51 
 
 		 349 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2162  ribonuclease Z  29.33 
 
 		 338 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0166615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2108  ribonuclease Z  28.17 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000254019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3742  ribonuclease Z  29.45 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689963  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1556  ribonuclease Z  26.8 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.312908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1403  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 338 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  29.93 
 
 		 309 aa  51.6  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1716  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.22 
 
 		 363 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  31.17 
 
 		 304 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1607  ribonuclease Z  28.57 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.35 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 335 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1175  ribonuclease Z  26.53 
 
 		 366 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  28.05 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  26.03 
 
 		 314 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  32.14 
 
 		 313 aa  47.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  34.52 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  34.52 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  34.52 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  34.52 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  34.52 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.38 
 
 		 309 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  27.81 
 
 		 309 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 262 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  36.05 
 
 		 244 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.14 
 
 		 312 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.02 
 
 		 327 aa  44.3  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  30.71 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  35.11 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  30.95 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  24.48 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  46.51 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05331  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.74 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  27.14 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25.17 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  37.18 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  25.85 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.12 
 
 		 312 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.63 
 
 		 312 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  36.73 
 
 		 315 aa  41.6  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  44.19 
 
 		 305 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  34.69 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  41.51 
 
 		 309 aa  41.2  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  44.19 
 
 		 307 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  26.14 
 
 		 312 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  29.27 
 
 		 285 aa  40.8  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  27.52 
 
 		 321 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 318 aa  40.8  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>