224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1966 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  58.24 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  56.87 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  55.73 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  44.27 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  37.45 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.35 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  37.8 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.74 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.07 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  37.75 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.35 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  38.15 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  30.83 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  33.7 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  35.82 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 		 796 aa  111  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  32.68 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  32.28 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  30.08 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  30.08 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  30.08 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.11 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  25 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.83 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.34 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.16 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  24.9 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  23.18 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  25.58 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  23.83 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28.32 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  21.9 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  32.8 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.44 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25.62 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  26.86 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.45 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.26 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.45 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.69 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.18 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  28.35 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  25.88 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  28.65 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0988  beta-lactamase domain protein  23.31 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  28.78 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  23.72 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.5 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  24.88 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3913  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  22.56 
 
 		 312 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  45 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.09 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.55 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  24.89 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.37 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  25.49 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  24.89 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0186  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000106094  normal  0.0583426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>