101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0134 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  38.98 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  38.43 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.5 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  37.4 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  34.65 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  39.5 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  39.83 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  37.25 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  36.12 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  35.1 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 796 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  26.11 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  25.12 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  25.98 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.28 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.28 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  27.45 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 411 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  25.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.39 
 
 		 432 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 322 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  27.39 
 
 		 553 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.45 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  23.56 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  40 
 
 		 561 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  22.42 
 
 		 452 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  28.99 
 
 		 393 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  26.4 
 
 		 813 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84281  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase (PDEase) (3':5'-CNP)  27.84 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.292629  normal  0.400104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 640 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 635 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.06 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.62 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.88 
 
 		 305 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 641 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0647  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 551 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.730868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.4 
 
 		 330 aa  45.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 641 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 553 aa  45.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 422 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 546 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 		 554 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  27.5 
 
 		 550 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.38 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.4 
 
 		 644 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  21.22 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.11 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.01 
 
 		 644 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  23.35 
 
 		 454 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  22.47 
 
 		 452 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  22.68 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  24.17 
 
 		 629 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.6 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 634 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  24.54 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  22.44 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.17 
 
 		 319 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 640 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 468 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 464 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 555 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2686  phosphonate metabolism protein PhnP  27.98 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 256 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 		 453 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.45 
 
 		 636 aa  42  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 254 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 550 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2687  beta-lactamase domain protein  21.94 
 
 		 591 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.95 
 
 		 312 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  31.07 
 
 		 265 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>