More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0647 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0647  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 551 aa  1070    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  40.11 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 		 561 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  40.77 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 554 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  40.21 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  41.45 
 
 		 558 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.18 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 593 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  40.61 
 
 		 553 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 554 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  39.89 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  40.99 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  39.82 
 
 		 547 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.94 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  43.01 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  42.49 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  41.92 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  41.88 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  37.77 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  37.77 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000603701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 551 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 568 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  39.89 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  42.55 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  35.78 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.6 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  35.42 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.6 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 555 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  42.24 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  35.3 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.6 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  40.32 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 560 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  41.85 
 
 		 564 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  41.81 
 
 		 595 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  34.25 
 
 		 573 aa  364  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.42 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  33.39 
 
 		 560 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  35.03 
 
 		 557 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.84 
 
 		 564 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 		 554 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  39.78 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 		 556 aa  360  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.87 
 
 		 717 aa  359  9e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  37.66 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  43.09 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  36.28 
 
 		 554 aa  358  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  43.09 
 
 		 546 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  40.95 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  36.54 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 650 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  33.39 
 
 		 677 aa  356  5.999999999999999e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 		 556 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  39.21 
 
 		 561 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  43.19 
 
 		 550 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 		 645 aa  355  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 664 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 		 563 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  39.96 
 
 		 561 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  40.64 
 
 		 561 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  38.52 
 
 		 563 aa  353  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  36.45 
 
 		 551 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.76 
 
 		 561 aa  352  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 551 aa  352  7e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 		 552 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  43.37 
 
 		 550 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  36.27 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 		 583 aa  350  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 		 566 aa  350  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  38.84 
 
 		 675 aa  350  5e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 557 aa  349  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  38.68 
 
 		 556 aa  349  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  32.97 
 
 		 652 aa  348  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>