More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0063 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  72.93 
 
 
662 aa  924    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
664 aa  1378    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  59.27 
 
 
647 aa  823    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  74.24 
 
 
717 aa  945    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  73.74 
 
 
573 aa  917    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  73.1 
 
 
662 aa  926    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  68.66 
 
 
677 aa  884    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  71.81 
 
 
652 aa  925    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  72.93 
 
 
662 aa  924    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  73.11 
 
 
645 aa  940    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 
560 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  44.18 
 
 
555 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  43.45 
 
 
555 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  43.45 
 
 
555 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
559 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  43.74 
 
 
555 aa  485  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  41.49 
 
 
553 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  40.81 
 
 
618 aa  476  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 
553 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 
593 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
558 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  42.05 
 
 
554 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 
554 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  39.57 
 
 
558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  42.41 
 
 
555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  42.44 
 
 
555 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  41.17 
 
 
558 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 
558 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
558 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  41.24 
 
 
554 aa  459  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  40.11 
 
 
533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  40.26 
 
 
569 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.47 
 
 
555 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  38.28 
 
 
547 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 
561 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 
557 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  40.51 
 
 
566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  39.38 
 
 
551 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2917  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.97 
 
 
591 aa  442  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 
560 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3608  hypothetical protein  39.68 
 
 
589 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1846  hypothetical protein  39.61 
 
 
609 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0589  hypothetical protein  39.54 
 
 
596 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113307  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  39.27 
 
 
551 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  37.63 
 
 
560 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
555 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.23 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  40.75 
 
 
553 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 
551 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
555 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.42 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.45 
 
 
555 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 
565 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
561 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 
555 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
561 aa  429  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 
565 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 
555 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  39.09 
 
 
551 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 
569 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  39.18 
 
 
602 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4360  beta-lactamase domain protein  43.65 
 
 
583 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263724  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.93 
 
 
564 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 
588 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 
588 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 
559 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0066  hypothetical protein  39.57 
 
 
690 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.672737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0069  hypothetical protein  39.65 
 
 
679 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1744  hypothetical protein  38.43 
 
 
660 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  37.91 
 
 
556 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18611  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.08 
 
 
662 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  38.02 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  39.21 
 
 
552 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  37.84 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  37.84 
 
 
557 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.66 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18421  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.08 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.84 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.84 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.02 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17781  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.98 
 
 
662 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  37.48 
 
 
557 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 
549 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  35.55 
 
 
550 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 
583 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 
556 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  37.48 
 
 
556 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>