More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0064 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  82.99 
 
 
634 aa  1079    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  85.51 
 
 
634 aa  1130    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
635 aa  1291    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  85.2 
 
 
640 aa  1147    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  50.94 
 
 
636 aa  630  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 
642 aa  490  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  42.01 
 
 
639 aa  489  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  44.24 
 
 
635 aa  487  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
630 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 
635 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  42.59 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 
630 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.16 
 
 
636 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  41.31 
 
 
639 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  40.76 
 
 
636 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  38.12 
 
 
637 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  39.67 
 
 
647 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
646 aa  433  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 
641 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
635 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
635 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
635 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  39.4 
 
 
635 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  36.49 
 
 
644 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  35.56 
 
 
641 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 
635 aa  421  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  36.39 
 
 
640 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  35.46 
 
 
644 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  36.93 
 
 
634 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  36.42 
 
 
426 aa  294  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
422 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
422 aa  273  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 
422 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 
421 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
468 aa  226  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.4 
 
 
541 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
464 aa  220  7.999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.46 
 
 
543 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.37 
 
 
460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 
531 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  31.39 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
830 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 
460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  30.9 
 
 
476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
460 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
460 aa  213  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.42 
 
 
467 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
821 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  29.89 
 
 
469 aa  211  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  29.75 
 
 
467 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.47 
 
 
468 aa  210  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.6 
 
 
465 aa  210  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 
432 aa  209  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 
455 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
455 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
433 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 
468 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.88 
 
 
467 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.8 
 
 
540 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  30.33 
 
 
455 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.55 
 
 
467 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 
433 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  30.06 
 
 
468 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
433 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 
522 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.41 
 
 
455 aa  203  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.61 
 
 
466 aa  203  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 
544 aa  203  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.01 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
451 aa  201  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
433 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
452 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
465 aa  199  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 
468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.66 
 
 
452 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  30.87 
 
 
476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
472 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.99 
 
 
466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
455 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
467 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  32.23 
 
 
470 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
570 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
453 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  31.72 
 
 
455 aa  194  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 
464 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  28.54 
 
 
767 aa  194  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 
478 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  34.13 
 
 
485 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.17 
 
 
530 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 
428 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  29.42 
 
 
452 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
470 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>