278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_933 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  84.58 
 
 		 468 aa  835    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  83.08 
 
 		 468 aa  824    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 467 aa  969    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  45.28 
 
 		 522 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  45.04 
 
 		 525 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.61 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.74 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.31 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.47 
 
 		 536 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.22 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.21 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  43.87 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  44.3 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.97 
 
 		 530 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.21 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  41.33 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.69 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  42.13 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  43.92 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  40.88 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  43.16 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  43.71 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  41.58 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  43.74 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.06 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  41.28 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.88 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  41.99 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  40.77 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  41.76 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  39.74 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  40.52 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  41.59 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  42.77 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39.4 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  42.21 
 
 		 547 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  39.83 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.38 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.43 
 
 		 455 aa  362  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.02 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  41.36 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  41.11 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  39.83 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  41.23 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  41.15 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  41.24 
 
 		 453 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 		 465 aa  354  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.96 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  42.06 
 
 		 453 aa  353  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  38.94 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 		 472 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  38.63 
 
 		 603 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  38.63 
 
 		 459 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 536 aa  352  8e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 		 452 aa  352  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  38.63 
 
 		 472 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  38.63 
 
 		 472 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  38.63 
 
 		 472 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.31 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  38 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 		 452 aa  350  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 		 589 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.54 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.32 
 
 		 480 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  40.6 
 
 		 452 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 		 461 aa  347  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.59 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.32 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.16 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  40.95 
 
 		 467 aa  345  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  38.51 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  41.84 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  38.59 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  41.72 
 
 		 478 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.78 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>