More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0480 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  97.23 
 
 		 433 aa  867    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  73.44 
 
 		 433 aa  679    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  94.69 
 
 		 433 aa  853    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  888    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  54.59 
 
 		 432 aa  494  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  37.59 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  35.28 
 
 		 411 aa  260  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 		 422 aa  252  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.26 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.64 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 421 aa  229  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 426 aa  220  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 		 422 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  35.61 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  36.11 
 
 		 637 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 640 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 421 aa  209  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 		 634 aa  209  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 821 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 		 635 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 635 aa  203  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 642 aa  200  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 634 aa  199  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  35.73 
 
 		 636 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.98 
 
 		 830 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  33.62 
 
 		 635 aa  196  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 639 aa  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  32.87 
 
 		 635 aa  193  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 635 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 		 640 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 		 635 aa  189  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.74 
 
 		 647 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 646 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.9 
 
 		 644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 641 aa  183  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 641 aa  179  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  31.17 
 
 		 644 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  31.99 
 
 		 629 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 577 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 630 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  31.4 
 
 		 636 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 630 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 639 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 		 667 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  28.44 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  26.7 
 
 		 793 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  26.49 
 
 		 602 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  28.78 
 
 		 767 aa  157  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.45 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.4 
 
 		 634 aa  156  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.25 
 
 		 541 aa  156  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 515 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  27.98 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  28.39 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  27.93 
 
 		 469 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.03 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  26.16 
 
 		 441 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  28.32 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2642  hypothetical protein  26.97 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  25.93 
 
 		 884 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  27.78 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  31.21 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.97 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.79 
 
 		 464 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.31 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 460 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  27.23 
 
 		 453 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  26.48 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>