More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1600 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
421 aa  858    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  67.06 
 
 
422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
425 aa  331  1e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
428 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  42.53 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  39.24 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  41.84 
 
 
430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 
422 aa  294  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 
421 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.28 
 
 
410 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  35.31 
 
 
432 aa  246  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  32.7 
 
 
411 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
433 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
433 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
433 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 
411 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
411 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
433 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  33.91 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
414 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.02 
 
 
821 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
635 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
635 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
635 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
635 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
636 aa  192  9e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  29.98 
 
 
635 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  30.55 
 
 
637 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
635 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 
640 aa  182  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  33.11 
 
 
635 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 
634 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  28.6 
 
 
639 aa  177  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
635 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
630 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 
634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.31 
 
 
636 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
426 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  27.39 
 
 
647 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 
630 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  27.79 
 
 
640 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
422 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
422 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
422 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  28.42 
 
 
636 aa  159  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 
642 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
646 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  26.25 
 
 
644 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
641 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
421 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 
641 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  26.25 
 
 
644 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 
830 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.44 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
634 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
467 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.5 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  26.49 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
652 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
525 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  25 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  26.81 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.98 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.82 
 
 
466 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  29.35 
 
 
793 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  24.58 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
455 aa  130  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.11 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.42 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
577 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  24.94 
 
 
452 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
465 aa  127  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  24.95 
 
 
472 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
465 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2610  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 
473 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0355734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.59 
 
 
541 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.67 
 
 
466 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
451 aa  125  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
454 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
454 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
468 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  25.49 
 
 
452 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 
455 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
462 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  25.71 
 
 
602 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
531 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  23.77 
 
 
455 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  24.56 
 
 
453 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0797  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.62 
 
 
477 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  25.06 
 
 
452 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
464 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  25.27 
 
 
452 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>