278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2586 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  68.6 
 
 
465 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
465 aa  963    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  50.43 
 
 
464 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  49.25 
 
 
464 aa  500  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.75 
 
 
465 aa  482  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  42.98 
 
 
467 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  42.68 
 
 
468 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  42.98 
 
 
467 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  42.98 
 
 
467 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  42.76 
 
 
462 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  42.76 
 
 
462 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 
463 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  44.8 
 
 
476 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.44 
 
 
455 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.27 
 
 
467 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 
522 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  41.29 
 
 
462 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  43.61 
 
 
451 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.35 
 
 
464 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 
536 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  40.35 
 
 
535 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  42.98 
 
 
470 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
570 aa  359  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.77 
 
 
469 aa  358  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.04 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.09 
 
 
535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 
536 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  40.81 
 
 
515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.53 
 
 
467 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 
464 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 
541 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 
465 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
525 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.28 
 
 
468 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.04 
 
 
540 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.14 
 
 
543 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 
544 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.3 
 
 
466 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.14 
 
 
530 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 
536 aa  343  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.41 
 
 
490 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.14 
 
 
480 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.91 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.14 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 
478 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.78 
 
 
474 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
447 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  38.34 
 
 
484 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 
470 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.92 
 
 
490 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.67 
 
 
466 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  37.99 
 
 
464 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  38.41 
 
 
480 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.41 
 
 
480 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.08 
 
 
471 aa  332  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  37.78 
 
 
478 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
489 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  38.24 
 
 
480 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  39.86 
 
 
485 aa  329  7e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.95 
 
 
536 aa  329  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 
547 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.04 
 
 
481 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38 
 
 
464 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  36.4 
 
 
476 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 
531 aa  324  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  38.83 
 
 
478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
467 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
466 aa  316  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.87 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.5 
 
 
525 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.64 
 
 
532 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.87 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  37.69 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.32 
 
 
450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  36.95 
 
 
469 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 
542 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 
461 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 
468 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  37.02 
 
 
540 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 
465 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  37.78 
 
 
533 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  36.95 
 
 
453 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
460 aa  292  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  34.89 
 
 
452 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
457 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  35.03 
 
 
453 aa  289  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  36.84 
 
 
452 aa  289  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  36.64 
 
 
455 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  36.98 
 
 
535 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
460 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  35.36 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
460 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.89 
 
 
460 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  35.7 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>