More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1078 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 454 aa  929    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  83.48 
 
 		 454 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  59.07 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  58.17 
 
 		 452 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  56.79 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  56.86 
 
 		 452 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  53.98 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  54.87 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  54.14 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  54.55 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  54.02 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  55.31 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  53.88 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  52.09 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  53.02 
 
 		 467 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  50.22 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  51.44 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  51.66 
 
 		 455 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  54.95 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  53.74 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  52.99 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  51.22 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  53.95 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  51.44 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  53.95 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  54.18 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  53.95 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  53.95 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  51.44 
 
 		 455 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  54.18 
 
 		 603 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  48.12 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  52.43 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  54.18 
 
 		 589 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  54.22 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  54.22 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.23 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  50.44 
 
 		 452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  49.21 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  50.56 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  48.87 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  50.33 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  49.89 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  50.33 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.6 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  47.84 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  47.6 
 
 		 460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  46.94 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  45.27 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  46.05 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  41.31 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.92 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.98 
 
 		 536 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.7 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.04 
 
 		 525 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.48 
 
 		 524 aa  349  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.16 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.63 
 
 		 541 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  42.83 
 
 		 470 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 		 530 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  42.15 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  38.56 
 
 		 525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.81 
 
 		 540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  37.47 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  40.84 
 
 		 532 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  39.82 
 
 		 540 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  42.02 
 
 		 542 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40 
 
 		 474 aa  316  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  38.66 
 
 		 469 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.89 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.54 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 463 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.6 
 
 		 532 aa  311  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.2 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  37.61 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  40.05 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 462 aa  306  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 536 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 536 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 467 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  38.51 
 
 		 535 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  40.25 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  36.31 
 
 		 536 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.93 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.41 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 		 476 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>