More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2599 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  75.72 
 
 
477 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
472 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  99.79 
 
 
472 aa  958    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  99.79 
 
 
472 aa  958    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  99.78 
 
 
459 aa  931    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
603 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  93.63 
 
 
589 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  77.43 
 
 
467 aa  727    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  99.79 
 
 
472 aa  958    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  75.22 
 
 
468 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  72.79 
 
 
454 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  76.47 
 
 
470 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  58.31 
 
 
452 aa  531  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  53.45 
 
 
470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  57.52 
 
 
452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  57.68 
 
 
453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  57.87 
 
 
452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  57.17 
 
 
453 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 
452 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  53.98 
 
 
452 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  53.98 
 
 
452 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  53.42 
 
 
455 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  55.46 
 
 
473 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  54.65 
 
 
455 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  55.09 
 
 
455 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  54.65 
 
 
455 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  52.2 
 
 
454 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  52.2 
 
 
454 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  56.07 
 
 
454 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  56.07 
 
 
454 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  54.18 
 
 
454 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  52.55 
 
 
452 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  53.32 
 
 
454 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  50.44 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  53.24 
 
 
457 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50 
 
 
452 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  52.13 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  52.48 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  51.79 
 
 
454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  50.88 
 
 
452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  48.57 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  51.55 
 
 
454 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  50.23 
 
 
452 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  51.55 
 
 
454 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  50.11 
 
 
468 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  48.67 
 
 
455 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.41 
 
 
460 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  50.65 
 
 
461 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  50.33 
 
 
460 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  50.98 
 
 
460 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  43.81 
 
 
451 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  43.19 
 
 
476 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.84 
 
 
467 aa  352  7e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 
524 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.53 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 
468 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.43 
 
 
535 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.14 
 
 
525 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 
468 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.22 
 
 
525 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 
536 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 
522 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.18 
 
 
540 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.76 
 
 
466 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.75 
 
 
543 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.6 
 
 
474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
544 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  40.98 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.91 
 
 
541 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
570 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  39.41 
 
 
467 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.98 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 
464 aa  308  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  40.04 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.98 
 
 
530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.69 
 
 
465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 
464 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  40.72 
 
 
542 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  40.67 
 
 
532 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  39.91 
 
 
540 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.83 
 
 
466 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  36.77 
 
 
465 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 
467 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 
536 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
462 aa  300  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  41.39 
 
 
476 aa  300  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  39.19 
 
 
536 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 
467 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
536 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  36.38 
 
 
467 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 
463 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  36.75 
 
 
466 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 
531 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.38 
 
 
470 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 
535 aa  289  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.05 
 
 
464 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.71 
 
 
490 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 
515 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>