273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0171 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  59.89 
 
 
536 aa  690    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  66.6 
 
 
535 aa  773    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
536 aa  1117    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  58.61 
 
 
544 aa  660    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  76.31 
 
 
536 aa  857    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  57.43 
 
 
547 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  49.15 
 
 
525 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  48.71 
 
 
535 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  46.22 
 
 
522 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.34 
 
 
543 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  48.38 
 
 
469 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.45 
 
 
530 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.16 
 
 
541 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  47.75 
 
 
470 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.02 
 
 
468 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  45.84 
 
 
467 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.74 
 
 
540 aa  425  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 
570 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.95 
 
 
525 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.2 
 
 
536 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  45.82 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  45.63 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.7 
 
 
524 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.8 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.26 
 
 
469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.88 
 
 
466 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.04 
 
 
470 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.54 
 
 
474 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 
463 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  43.34 
 
 
476 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 
462 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.76 
 
 
465 aa  388  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.85 
 
 
462 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  45.69 
 
 
467 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42 
 
 
531 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 
464 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.52 
 
 
455 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.24 
 
 
467 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
465 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.26 
 
 
465 aa  364  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 
515 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.4 
 
 
468 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  41.49 
 
 
464 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  42.37 
 
 
461 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  42.12 
 
 
542 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  39.44 
 
 
465 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  42.95 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.32 
 
 
532 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.12 
 
 
468 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  41.69 
 
 
540 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  41.16 
 
 
532 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  39.17 
 
 
464 aa  355  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  41.16 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.97 
 
 
467 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.57 
 
 
471 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
460 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 
464 aa  349  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  41.59 
 
 
484 aa  349  9e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  41.79 
 
 
469 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.63 
 
 
490 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  39.7 
 
 
453 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.95 
 
 
460 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 
462 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
462 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  39.87 
 
 
478 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  40.9 
 
 
451 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 
452 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  40.44 
 
 
478 aa  340  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  38.45 
 
 
470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.36 
 
 
480 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 
466 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  40.58 
 
 
480 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.58 
 
 
480 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 
478 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.73 
 
 
480 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.47 
 
 
490 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.73 
 
 
480 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  41.14 
 
 
533 aa  332  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.16 
 
 
481 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.73 
 
 
480 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 
465 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 
464 aa  329  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  38.77 
 
 
467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.07 
 
 
464 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  40.27 
 
 
535 aa  326  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  37.13 
 
 
476 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 
465 aa  323  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.92 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 
452 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 
453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 
454 aa  319  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
454 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  38.49 
 
 
452 aa  319  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  39.87 
 
 
447 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  37.55 
 
 
455 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.85 
 
 
454 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
489 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  40.96 
 
 
485 aa  317  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
477 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>