More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2580 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 454 aa  913    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  99.78 
 
 		 454 aa  911    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  69.62 
 
 		 454 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  57.08 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  56.86 
 
 		 452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  55.53 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  54 
 
 		 453 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  53.3 
 
 		 452 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  52.24 
 
 		 453 aa  461  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  54.97 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  55.19 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  55.19 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  53.08 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  52.86 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  52.85 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  52.43 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  52.21 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  51.77 
 
 		 454 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  51.11 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  50.44 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  50.9 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  50.44 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  46.76 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  49.34 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  52.43 
 
 		 589 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  51.33 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  51.55 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  51.33 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  51.33 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.34 
 
 		 452 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  51.55 
 
 		 603 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  51.33 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  49.33 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  51.55 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  48.45 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  49.67 
 
 		 473 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  50.33 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  46.9 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  46.46 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  47.69 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  45.15 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  48.12 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  47.7 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  49.67 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  49.67 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.57 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  44.37 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  48.37 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  46.71 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  43.68 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.29 
 
 		 536 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.1 
 
 		 544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  38.06 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 522 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.45 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 536 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.4 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 525 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 536 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  40.75 
 
 		 532 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.48 
 
 		 525 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.18 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.77 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.52 
 
 		 541 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  38.33 
 
 		 469 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 542 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  40.22 
 
 		 540 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 524 aa  308  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 547 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.98 
 
 		 540 aa  306  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  40.45 
 
 		 533 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.59 
 
 		 543 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.7 
 
 		 532 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.4 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.68 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.54 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 		 570 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.67 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.25 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.46 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.56 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  37.28 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  36.03 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.19 
 
 		 469 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 462 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 		 467 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  39 
 
 		 535 aa  282  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.47 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 		 462 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  37.77 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 		 463 aa  279  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>