283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0095 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 474 aa  959    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  61.13 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  57.32 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  56.48 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  59.16 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  56.18 
 
 		 470 aa  501  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.89 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.26 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  47.15 
 
 		 522 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.85 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.61 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.78 
 
 		 540 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  48.02 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  47.37 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  46.35 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.32 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  47.16 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  45.06 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  44.47 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.01 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  45.36 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  43.79 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  44.54 
 
 		 536 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.56 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  45.49 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  44.21 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  44.61 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  43.59 
 
 		 570 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  45.43 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  43.76 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 536 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  43.46 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  45.07 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.59 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  42.71 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  44.02 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.48 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  42.86 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  43.13 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.42 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.19 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  43.08 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  46.57 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.42 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.2 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  44.04 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  42.64 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.64 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  42.04 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  41.45 
 
 		 478 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 		 455 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  43.01 
 
 		 470 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41 
 
 		 481 aa  362  9e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.52 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.04 
 
 		 490 aa  359  5e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  46.04 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.61 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  45.4 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.45 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.45 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.12 
 
 		 490 aa  352  7e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  43.31 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.83 
 
 		 467 aa  349  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  40.88 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.62 
 
 		 464 aa  346  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  40.67 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  43.67 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  43.67 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.76 
 
 		 465 aa  346  7e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  42.62 
 
 		 452 aa  345  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  41.98 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 		 464 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 465 aa  342  8e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  43.36 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  41.68 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 465 aa  340  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  42.27 
 
 		 452 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  42.59 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  42.02 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  41.1 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  42.86 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  41.47 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  41.36 
 
 		 468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  43.38 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  40.72 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.41 
 
 		 532 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  41.94 
 
 		 453 aa  331  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  42.05 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  39.53 
 
 		 476 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>