261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3890 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  100 
 
 
476 aa  991    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  45.97 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  45.09 
 
 
453 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  46.3 
 
 
460 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  46.32 
 
 
461 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  45.55 
 
 
452 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  45.55 
 
 
452 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  45.88 
 
 
460 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.67 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  45.32 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  46.34 
 
 
473 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  43.74 
 
 
452 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  42.68 
 
 
477 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  45.77 
 
 
454 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  45.22 
 
 
455 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  43.22 
 
 
452 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 
452 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  43.71 
 
 
452 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  43.86 
 
 
455 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  44.11 
 
 
472 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  43.89 
 
 
570 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.88 
 
 
467 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  42.53 
 
 
453 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.84 
 
 
468 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  43.19 
 
 
472 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  42.98 
 
 
472 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  42.98 
 
 
472 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  42.98 
 
 
459 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  43.4 
 
 
603 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  42.98 
 
 
472 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  43.5 
 
 
467 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 
470 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.61 
 
 
452 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
454 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 
460 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  41.56 
 
 
452 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  44.68 
 
 
457 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 
525 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  42.07 
 
 
455 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  41.65 
 
 
455 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  43.04 
 
 
452 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 
468 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 
461 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  41.65 
 
 
455 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 
468 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  39.83 
 
 
522 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  42.55 
 
 
589 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 
454 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  42.4 
 
 
452 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  42.74 
 
 
468 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  39.62 
 
 
452 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  42.11 
 
 
454 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.42 
 
 
536 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 
454 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 
454 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  43.23 
 
 
454 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  43.23 
 
 
454 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  43.68 
 
 
454 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  43.68 
 
 
454 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.11 
 
 
525 aa  359  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.45 
 
 
530 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.74 
 
 
541 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  40.93 
 
 
470 aa  352  7e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  41.24 
 
 
451 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 
524 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.66 
 
 
469 aa  347  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.04 
 
 
543 aa  347  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 
464 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  39.87 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 
536 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.74 
 
 
540 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
535 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 
544 aa  333  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.42 
 
 
468 aa  333  5e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 
536 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  38.98 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  37.13 
 
 
536 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.53 
 
 
474 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 
465 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 
467 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 
547 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.29 
 
 
470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  36.12 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  38.76 
 
 
532 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 
535 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.35 
 
 
467 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  39 
 
 
540 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 
463 aa  316  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.01 
 
 
532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  38.23 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.97 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  39.11 
 
 
533 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.77 
 
 
471 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  38.68 
 
 
462 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 
462 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  37.67 
 
 
470 aa  310  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.27 
 
 
465 aa  309  9e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>