More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0816 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 462 aa  943    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  67.47 
 
 		 465 aa  634    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  63.76 
 
 		 464 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  63.1 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  62.36 
 
 		 465 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.78 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  49.36 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  51.23 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.23 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  50.56 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.57 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  50.78 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  51.12 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  51.23 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.57 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.07 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  50.11 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.24 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.03 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  50.57 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.43 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  45.61 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  45.61 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.16 
 
 		 468 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  47.53 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  47.1 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  43.47 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.08 
 
 		 536 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.38 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.83 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  42.76 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  47.2 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.64 
 
 		 470 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.76 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 525 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.54 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.61 
 
 		 543 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.83 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  41.74 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.27 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.3 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  42.06 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.92 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  41.14 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.48 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  42.83 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.33 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  41.11 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  42.27 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 536 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  43.98 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  42.54 
 
 		 515 aa  362  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.09 
 
 		 467 aa  362  9e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  43.86 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 		 525 aa  359  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.42 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 465 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  42.98 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.82 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.11 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  41.47 
 
 		 469 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 		 536 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.22 
 
 		 465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 		 467 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  41.3 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  42.39 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  39.08 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  37.94 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  38.9 
 
 		 455 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  37.72 
 
 		 452 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  38.95 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 453 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.21 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  39.25 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  38.9 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  39.04 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 454 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  37.83 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  38.9 
 
 		 452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.34 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  38.51 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>