259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4088 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  76.65 
 
 		 533 aa  819    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  78.38 
 
 		 542 aa  843    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  100 
 
 		 532 aa  1069    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  75.89 
 
 		 540 aa  818    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  75.61 
 
 		 532 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  49.91 
 
 		 547 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  45.51 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  48.32 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.19 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.02 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  43.78 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.46 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.8 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  39.63 
 
 		 535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  42.51 
 
 		 570 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  41.16 
 
 		 536 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.84 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.27 
 
 		 525 aa  345  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.76 
 
 		 540 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39 
 
 		 536 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.86 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  40.58 
 
 		 547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  41.94 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  43.72 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  40.84 
 
 		 454 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.01 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  41.32 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.89 
 
 		 469 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  40.97 
 
 		 454 aa  319  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  38.76 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  40.75 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.14 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.5 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  42.21 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  41.92 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  43.08 
 
 		 469 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  40.72 
 
 		 452 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  41.54 
 
 		 467 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  40.84 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  42.33 
 
 		 460 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.13 
 
 		 469 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  39.59 
 
 		 535 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  41.29 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 		 452 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  41.39 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  40.53 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 467 aa  307  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.12 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.78 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  41.11 
 
 		 589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  39.73 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  39.96 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  40.67 
 
 		 472 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  40.44 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  40.44 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  39.2 
 
 		 531 aa  302  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  40.44 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  40.44 
 
 		 459 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  40.67 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.58 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.31 
 
 		 465 aa  301  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39 
 
 		 471 aa  299  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  37.68 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 465 aa  299  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  38.84 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.75 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 		 468 aa  297  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 454 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  38 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.63 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.92 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.48 
 
 		 464 aa  292  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 470 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.57 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.58 
 
 		 452 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  38.38 
 
 		 455 aa  289  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 		 477 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 		 476 aa  286  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>