271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1267 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 
465 aa  956    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  58.08 
 
 
464 aa  560  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  54.51 
 
 
464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  52.78 
 
 
465 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  50.75 
 
 
465 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  48.53 
 
 
451 aa  404  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  43.05 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  43.05 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 
535 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.04 
 
 
524 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.14 
 
 
536 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 
536 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 
522 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.11 
 
 
541 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  40.34 
 
 
467 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  42.89 
 
 
535 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  43.38 
 
 
536 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  42.96 
 
 
525 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  40.34 
 
 
467 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.76 
 
 
455 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.23 
 
 
467 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.64 
 
 
544 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.3 
 
 
468 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  42.06 
 
 
570 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.36 
 
 
466 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
462 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  40.35 
 
 
469 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  41.99 
 
 
531 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 
547 aa  362  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.07 
 
 
530 aa  362  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 
536 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  43.85 
 
 
515 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.02 
 
 
467 aa  362  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  40.13 
 
 
470 aa  359  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  39.26 
 
 
464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.42 
 
 
540 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  42.06 
 
 
467 aa  355  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  39.7 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.03 
 
 
543 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
468 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.26 
 
 
490 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 
462 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  37.55 
 
 
463 aa  350  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.47 
 
 
490 aa  349  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.04 
 
 
464 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.41 
 
 
480 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.62 
 
 
480 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.19 
 
 
480 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.93 
 
 
525 aa  345  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 
468 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  37.45 
 
 
467 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  38.97 
 
 
469 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  41.33 
 
 
485 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.74 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.35 
 
 
469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 
465 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.79 
 
 
471 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  39.95 
 
 
478 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.76 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  39.59 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  40.27 
 
 
480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.27 
 
 
480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.46 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
447 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 
478 aa  335  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.87 
 
 
481 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 
484 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 
489 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 
468 aa  329  6e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 
465 aa  329  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.96 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
464 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  38.14 
 
 
478 aa  325  9e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
461 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 
466 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 
457 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
464 aa  316  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.95 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 
460 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  36.96 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  36.27 
 
 
476 aa  309  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.26 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  36.48 
 
 
468 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  36.31 
 
 
532 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  35.36 
 
 
452 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 
465 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  37.88 
 
 
452 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  36.44 
 
 
452 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.78 
 
 
467 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  36.09 
 
 
540 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  37.81 
 
 
465 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  35.98 
 
 
455 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 
542 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  39.11 
 
 
533 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  36.15 
 
 
455 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
454 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 
454 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  37.12 
 
 
470 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  35.93 
 
 
455 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>