More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1508 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  73.67 
 
 		 453 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  76.99 
 
 		 452 aa  725    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 452 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  74.06 
 
 		 452 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  66.29 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  62.97 
 
 		 452 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  56.54 
 
 		 452 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  58.19 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  56.32 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  56.42 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  56.76 
 
 		 455 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  57.4 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  57.43 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  59.51 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  59.51 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  57.65 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  57.65 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  57.65 
 
 		 459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  57.87 
 
 		 603 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  57.87 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  56.86 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  56.86 
 
 		 454 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  57.65 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  55.88 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  55.65 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  56.19 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  55.88 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  57.87 
 
 		 589 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  56.01 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  54.32 
 
 		 454 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  55.31 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  54.32 
 
 		 454 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  54.1 
 
 		 452 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  53.52 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  54.87 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  54.32 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  52.1 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.99 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  53.32 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  52.99 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  52.89 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  53.6 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  52.58 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  52.93 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  51.54 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.31 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  51.42 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  51.31 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  46.58 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  49.78 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  43.74 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  47.47 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.46 
 
 		 536 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.77 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 		 525 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.21 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.25 
 
 		 525 aa  349  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  38.88 
 
 		 522 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.79 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  42.39 
 
 		 469 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.66 
 
 		 543 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.08 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 		 524 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.74 
 
 		 541 aa  336  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.65 
 
 		 544 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.26 
 
 		 535 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  38.44 
 
 		 570 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.7 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 536 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.17 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.43 
 
 		 540 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 		 464 aa  326  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 		 465 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  39.96 
 
 		 469 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 		 536 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.43 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.08 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 		 462 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 		 536 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.92 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  38.92 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40 
 
 		 474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  40.67 
 
 		 542 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  39.96 
 
 		 532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 		 466 aa  302  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.99 
 
 		 466 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.69 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 468 aa  295  8e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.56 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 547 aa  295  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  38.31 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.02 
 
 		 490 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.8 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  39.69 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>