More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2360 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  976    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  60.4 
 
 
452 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  60.18 
 
 
452 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  55.01 
 
 
452 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  55.53 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  56.42 
 
 
452 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  55.75 
 
 
453 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  53.98 
 
 
455 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  56.57 
 
 
452 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  53.76 
 
 
454 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  54.59 
 
 
453 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  53.23 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  53.23 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  53.45 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  53.45 
 
 
603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  53.23 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  53.76 
 
 
459 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  53.45 
 
 
455 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  52.34 
 
 
455 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  52.56 
 
 
455 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  53.32 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  51.94 
 
 
589 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  51.11 
 
 
454 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  50.44 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  51.11 
 
 
454 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  51.56 
 
 
473 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  50.11 
 
 
472 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  51.32 
 
 
455 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.22 
 
 
452 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 
454 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  50.22 
 
 
454 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
470 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  49.78 
 
 
452 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  49.56 
 
 
467 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
453 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  52.01 
 
 
454 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  52.01 
 
 
454 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  49.11 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  51.35 
 
 
457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  49.67 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  47.43 
 
 
468 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  48.88 
 
 
452 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 
452 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  46.09 
 
 
461 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  46.76 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  46.76 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  45.67 
 
 
460 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  45.41 
 
 
451 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  45.43 
 
 
460 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.69 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  45.97 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  42.83 
 
 
461 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  42.26 
 
 
460 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.74 
 
 
536 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.52 
 
 
467 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.51 
 
 
524 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  41.38 
 
 
468 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.24 
 
 
525 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  39.83 
 
 
522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.04 
 
 
525 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 
468 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 
570 aa  359  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.56 
 
 
543 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.01 
 
 
474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.15 
 
 
541 aa  346  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  40.74 
 
 
469 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.34 
 
 
540 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 
470 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  41.15 
 
 
469 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.89 
 
 
530 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 
544 aa  329  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  37.63 
 
 
535 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  37.94 
 
 
462 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.32 
 
 
471 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  37.99 
 
 
467 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  37.99 
 
 
467 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  36.64 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
535 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.58 
 
 
481 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.13 
 
 
465 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 
465 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 
547 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  40.04 
 
 
515 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 
536 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 
465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 
467 aa  309  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.51 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.51 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  37.99 
 
 
467 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 
464 aa  306  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.65 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  39.91 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  40.22 
 
 
478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  37.15 
 
 
536 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 
489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 
480 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.94 
 
 
480 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 
478 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>