More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1708 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 454 aa  915    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 454 aa  915    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  59.73 
 
 		 452 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  59.51 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  57.49 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  56.07 
 
 		 452 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  56.26 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  54.75 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  53.42 
 
 		 455 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  55.85 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  57.3 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  54.08 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  53.2 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  54.14 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  55.85 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  56.07 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  55.85 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  55.85 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  52.01 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  52.54 
 
 		 452 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  56.07 
 
 		 603 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  55.85 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  52.32 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  54.5 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  54.22 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  55.19 
 
 		 589 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  54.5 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  54.3 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  54.67 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  55.19 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  53.54 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  53.96 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  55.19 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  51.66 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  53.15 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  53.05 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  53.14 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.9 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  51.76 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  49.45 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  49.45 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  50.68 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  53.26 
 
 		 468 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  50.45 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.32 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  47.58 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  46.59 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  43.23 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.82 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.3 
 
 		 536 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 570 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 		 543 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.1 
 
 		 541 aa  359  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 522 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.09 
 
 		 474 aa  349  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.09 
 
 		 469 aa  346  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.1 
 
 		 540 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  42.14 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.21 
 
 		 470 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.21 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.31 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.34 
 
 		 535 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.4 
 
 		 530 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.74 
 
 		 525 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  40.34 
 
 		 464 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.58 
 
 		 469 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  42.15 
 
 		 542 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  39.18 
 
 		 515 aa  327  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 		 544 aa  325  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 462 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.35 
 
 		 532 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.54 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  40.64 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  41.48 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.3 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  40.76 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 		 536 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  39.08 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  41.2 
 
 		 532 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  41.28 
 
 		 533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  40.55 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 536 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 		 463 aa  313  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  39.57 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 		 464 aa  309  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>