297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0944 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  83.76 
 
 
468 aa  833    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  83.08 
 
 
467 aa  824    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
468 aa  970    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  46.14 
 
 
522 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  45.04 
 
 
525 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.75 
 
 
536 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  43.36 
 
 
570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.78 
 
 
543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.53 
 
 
541 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  44.3 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.44 
 
 
540 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  44.09 
 
 
469 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.58 
 
 
474 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.17 
 
 
535 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.81 
 
 
530 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  42.18 
 
 
544 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  43.5 
 
 
547 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.98 
 
 
464 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  41.77 
 
 
464 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.9 
 
 
525 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  40.6 
 
 
536 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  42.95 
 
 
467 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 
461 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  40.65 
 
 
476 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  42.2 
 
 
468 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  42.52 
 
 
467 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 
467 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  41.11 
 
 
462 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
467 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.65 
 
 
469 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  41.16 
 
 
462 aa  365  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 
460 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  41.59 
 
 
460 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 
536 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  39.4 
 
 
536 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  40.52 
 
 
470 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 
462 aa  360  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.03 
 
 
462 aa  360  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.71 
 
 
465 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.65 
 
 
468 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 
455 aa  359  7e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.59 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  40.47 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  40.64 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 
457 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  39.31 
 
 
535 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.82 
 
 
455 aa  355  7.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  38.83 
 
 
470 aa  354  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.86 
 
 
460 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  41.06 
 
 
452 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.83 
 
 
470 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  40.72 
 
 
453 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
453 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  40.64 
 
 
452 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  40.25 
 
 
470 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.89 
 
 
466 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.86 
 
 
465 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.98 
 
 
466 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 
465 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 
454 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
454 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.44 
 
 
480 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.57 
 
 
490 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 
465 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.44 
 
 
480 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  39.51 
 
 
464 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.44 
 
 
480 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  39.79 
 
 
452 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 
464 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.91 
 
 
467 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 
463 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  37.55 
 
 
460 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  39.4 
 
 
467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 
455 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.04 
 
 
471 aa  340  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 
452 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  37.26 
 
 
455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  41.15 
 
 
452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  40.4 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  37.39 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 
477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  39.96 
 
 
468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 
468 aa  336  7e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  40.99 
 
 
453 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  37.79 
 
 
473 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 
531 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.23 
 
 
454 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 
455 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  39.78 
 
 
480 aa  332  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  37.47 
 
 
472 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  40.44 
 
 
478 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
454 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
454 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  39.77 
 
 
467 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  38.56 
 
 
452 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 
466 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>