More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1967 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  100 
 
 		 454 aa  925    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  69.84 
 
 		 454 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  69.62 
 
 		 454 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  56.35 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  57.4 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  55.23 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  55.01 
 
 		 453 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  55.16 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  52.44 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  49.11 
 
 		 470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  57.3 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  54.02 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  57.3 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  49.44 
 
 		 455 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  50.67 
 
 		 454 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  50.67 
 
 		 454 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  52.78 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  52.23 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  53.35 
 
 		 468 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  51.45 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  50.89 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.22 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  51.67 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  50.44 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  51 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  51.67 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  49.77 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  51.57 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  51.57 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  51.79 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  51.57 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  49.33 
 
 		 452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  49.1 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  51.79 
 
 		 603 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  51.57 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  49.22 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  49.44 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  47.87 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  52.34 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  50.56 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  52.02 
 
 		 589 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  50.23 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  49.44 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  48.66 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  50.67 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  47.77 
 
 		 472 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  50.33 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.9 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  47.47 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  45.77 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  46.46 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.43 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.22 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  41.94 
 
 		 532 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 525 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.5 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  39.09 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.68 
 
 		 467 aa  322  6e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.04 
 
 		 535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.27 
 
 		 541 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  38.63 
 
 		 536 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.88 
 
 		 540 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.54 
 
 		 543 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  39.83 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.56 
 
 		 536 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.36 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.36 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.62 
 
 		 532 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  40.31 
 
 		 542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  40.64 
 
 		 533 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 		 522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.92 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  40.31 
 
 		 540 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.85 
 
 		 530 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.31 
 
 		 525 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  38.92 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  39.06 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.34 
 
 		 471 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.69 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.76 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.98 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 462 aa  280  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.06 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>