262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1898 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  75.71 
 
 		 533 aa  826    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  75.61 
 
 		 532 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  76.75 
 
 		 540 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 532 aa  1088    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  74.67 
 
 		 542 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  48.02 
 
 		 547 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  44.07 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  47.1 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  44.1 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.71 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.01 
 
 		 543 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  43.55 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.7 
 
 		 536 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  45.76 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.18 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.49 
 
 		 530 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  41.37 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  41.32 
 
 		 536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.07 
 
 		 525 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  41.96 
 
 		 536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  41.39 
 
 		 536 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  42.6 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  41.19 
 
 		 544 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  39.24 
 
 		 547 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.41 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  42.64 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  42.34 
 
 		 464 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  39.1 
 
 		 465 aa  322  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.42 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  42.89 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 535 aa  317  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.95 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  39.01 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  41.19 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  39.44 
 
 		 467 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  39.4 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  38.24 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.44 
 
 		 468 aa  309  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  40.62 
 
 		 454 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  40.72 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  40 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  41.72 
 
 		 467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  37.87 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.97 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 454 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.09 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.35 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  38.7 
 
 		 454 aa  300  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  38.39 
 
 		 452 aa  299  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  39.24 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  38.84 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  38.88 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.86 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 		 460 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.74 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.72 
 
 		 468 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.81 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.92 
 
 		 466 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 465 aa  289  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  35.99 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.98 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  37.12 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  37.36 
 
 		 452 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  38.75 
 
 		 455 aa  286  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 		 472 aa  286  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.17 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  36.86 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  36.18 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 452 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  36.92 
 
 		 452 aa  283  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 		 464 aa  282  9e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.1 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  38.79 
 
 		 452 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  38.72 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 465 aa  276  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.63 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  37.09 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>