259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1400 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 535 aa  1107    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  51.19 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  48.19 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  48.71 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  44.85 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.76 
 
 		 541 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  48.28 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.35 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  46.49 
 
 		 525 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.59 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  45.66 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.95 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.61 
 
 		 525 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  44.98 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  40.4 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  41.82 
 
 		 570 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.47 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.3 
 
 		 530 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  42.24 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  42.24 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  43.02 
 
 		 515 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  45.26 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.56 
 
 		 470 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  43.29 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.67 
 
 		 464 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.89 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  43.35 
 
 		 531 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.32 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  41.36 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  41.23 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.47 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  42.55 
 
 		 462 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  42.55 
 
 		 462 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.96 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.58 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.31 
 
 		 467 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.56 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.39 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  40.35 
 
 		 465 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.99 
 
 		 466 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  43.81 
 
 		 485 aa  360  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  40.52 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.31 
 
 		 468 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.39 
 
 		 471 aa  355  7.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.43 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 467 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  40.53 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.91 
 
 		 464 aa  349  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 451 aa  340  5e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 		 465 aa  339  9e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.49 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  38.82 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.07 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.94 
 
 		 467 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 		 460 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.87 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.87 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  39.01 
 
 		 462 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.87 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.64 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  41.76 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.39 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  41.16 
 
 		 542 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  39.64 
 
 		 470 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  39.2 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.62 
 
 		 480 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 		 466 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  39.82 
 
 		 480 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.82 
 
 		 480 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  39.03 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  36.46 
 
 		 540 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  37.9 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.38 
 
 		 532 aa  316  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  39.41 
 
 		 478 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  38.7 
 
 		 470 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 		 453 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  39.59 
 
 		 532 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.6 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 465 aa  309  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  37.37 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.36 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  38.21 
 
 		 452 aa  306  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 		 454 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  37.12 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  37.6 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 454 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  39.08 
 
 		 454 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>