284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0851 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
464 aa  950    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  54.51 
 
 
465 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  51.63 
 
 
464 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  50.43 
 
 
465 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  51.52 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  47.39 
 
 
462 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  47.39 
 
 
462 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  47.53 
 
 
451 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  45.52 
 
 
524 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  42.92 
 
 
535 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  42.67 
 
 
522 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  45.52 
 
 
515 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.95 
 
 
541 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
463 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  42.13 
 
 
544 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  43.27 
 
 
570 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.95 
 
 
455 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.87 
 
 
525 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.03 
 
 
464 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.92 
 
 
543 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.7 
 
 
536 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 
536 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  41.56 
 
 
470 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 
462 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  41.36 
 
 
535 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  43.93 
 
 
531 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.96 
 
 
466 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  41.25 
 
 
485 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41 
 
 
530 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  40.52 
 
 
467 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  41.14 
 
 
462 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  41.87 
 
 
468 aa  368  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  40.3 
 
 
467 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  40.97 
 
 
469 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 
547 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 
476 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  39.96 
 
 
536 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 
468 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 
465 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 
484 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.69 
 
 
540 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.94 
 
 
470 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  41.11 
 
 
467 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.6 
 
 
466 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 
536 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.63 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.13 
 
 
467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 
467 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 
464 aa  354  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.99 
 
 
480 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.99 
 
 
480 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
465 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.99 
 
 
480 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41 
 
 
481 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
447 aa  346  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
464 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  40.92 
 
 
467 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  41.08 
 
 
478 aa  343  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
468 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  40.45 
 
 
480 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.45 
 
 
480 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.18 
 
 
525 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  40.32 
 
 
480 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.98 
 
 
471 aa  340  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  40.77 
 
 
478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.47 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  40.4 
 
 
478 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
489 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38 
 
 
490 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.72 
 
 
450 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.35 
 
 
468 aa  330  4e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.77 
 
 
469 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 
466 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  39.6 
 
 
542 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  40.57 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  37.66 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.05 
 
 
532 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  37.86 
 
 
470 aa  310  4e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  38.9 
 
 
540 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  37.24 
 
 
461 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  38.91 
 
 
532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  36.29 
 
 
476 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 
460 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  38.5 
 
 
533 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 
525 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  37.25 
 
 
455 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 
460 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 
453 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 
547 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.84 
 
 
460 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  37.64 
 
 
454 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  37.64 
 
 
454 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
457 aa  289  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  36.91 
 
 
452 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  36.38 
 
 
470 aa  285  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  38.13 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 
452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>