More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  75 
 
 
467 aa  735    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
468 aa  964    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  74.57 
 
 
467 aa  732    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  77.99 
 
 
467 aa  750    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.63 
 
 
466 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  54.7 
 
 
466 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  52.01 
 
 
455 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.01 
 
 
467 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  51.4 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  48.93 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  45.16 
 
 
462 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  47.02 
 
 
536 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  47.1 
 
 
464 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 
465 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  48.92 
 
 
469 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  48.39 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.1 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.49 
 
 
543 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  45.81 
 
 
547 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  46 
 
 
462 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  44.11 
 
 
465 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
465 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  48.22 
 
 
484 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.49 
 
 
541 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  42.52 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  43.64 
 
 
544 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.01 
 
 
474 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  44.14 
 
 
535 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  48.62 
 
 
467 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  44.47 
 
 
536 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.95 
 
 
536 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  44.14 
 
 
468 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.37 
 
 
480 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.55 
 
 
540 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  42.46 
 
 
522 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.49 
 
 
490 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  46.14 
 
 
480 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  44.97 
 
 
464 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  46.46 
 
 
478 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  46.92 
 
 
478 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.15 
 
 
490 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.14 
 
 
480 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.15 
 
 
480 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  44.07 
 
 
531 aa  385  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  42.47 
 
 
525 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  47.37 
 
 
480 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.37 
 
 
480 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 
524 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.24 
 
 
470 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  45.56 
 
 
478 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 
489 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  43.74 
 
 
467 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.66 
 
 
469 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 
536 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.13 
 
 
465 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.14 
 
 
481 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 
535 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 
464 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  41.65 
 
 
468 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  42.32 
 
 
515 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.26 
 
 
525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  38.9 
 
 
464 aa  356  5.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.11 
 
 
465 aa  352  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  42.68 
 
 
451 aa  350  3e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  42.29 
 
 
462 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  42.29 
 
 
462 aa  350  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.37 
 
 
471 aa  348  8e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.97 
 
 
530 aa  340  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.9 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 
468 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  40.98 
 
 
457 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  40.13 
 
 
455 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  39.91 
 
 
473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  43.45 
 
 
485 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  40.34 
 
 
455 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  40.13 
 
 
455 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.65 
 
 
452 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
453 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1602  beta-lactamase-like  42.22 
 
 
535 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  41.41 
 
 
540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  39.91 
 
 
452 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 
466 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
452 aa  309  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  41.54 
 
 
468 aa  309  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 
455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 
472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  38.91 
 
 
455 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  40.78 
 
 
532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  38.9 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  40.53 
 
 
542 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.53 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  39.27 
 
 
452 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 
460 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  41.61 
 
 
452 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>