277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4158 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  77.52 
 
 		 478 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  100 
 
 		 478 aa  986    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  78.15 
 
 		 478 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  78.45 
 
 		 480 aa  798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  73.11 
 
 		 481 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  73.11 
 
 		 489 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  72.9 
 
 		 490 aa  728    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  78.66 
 
 		 480 aa  799    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  78.57 
 
 		 480 aa  801    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  78.57 
 
 		 480 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  71.07 
 
 		 490 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  79.83 
 
 		 480 aa  814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  78.45 
 
 		 480 aa  796    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  72.06 
 
 		 484 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  51.27 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  51.68 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  50.34 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  50.67 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  50.57 
 
 		 462 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.3 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  48.29 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  48.47 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.92 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.81 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  46.89 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  47.11 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  44.87 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  45.31 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.89 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.56 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.13 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.64 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 		 522 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.71 
 
 		 541 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42.32 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.5 
 
 		 536 aa  362  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.04 
 
 		 474 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 570 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.53 
 
 		 543 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.89 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.04 
 
 		 469 aa  348  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40.75 
 
 		 536 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  40.51 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39.58 
 
 		 536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.3 
 
 		 471 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  42.89 
 
 		 524 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 		 547 aa  342  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 		 544 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40 
 
 		 530 aa  340  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  41.65 
 
 		 462 aa  339  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  41.65 
 
 		 462 aa  339  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  40.4 
 
 		 464 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  39.14 
 
 		 469 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 		 535 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.71 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.14 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.92 
 
 		 470 aa  324  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.45 
 
 		 468 aa  323  5e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.82 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 		 451 aa  315  9e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.83 
 
 		 468 aa  313  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 		 547 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.04 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  38.38 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.2 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  38.98 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.67 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  39.13 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  37.03 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  36.06 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  36.12 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  37.1 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  37.08 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  35.94 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 452 aa  279  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  37.81 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>