More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2052 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  70.81 
 
 		 644 aa  967    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  53.13 
 
 		 637 aa  707    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  54.32 
 
 		 630 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  53.03 
 
 		 636 aa  723    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  48.75 
 
 		 635 aa  639    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  55.42 
 
 		 629 aa  733    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  55.11 
 
 		 639 aa  749    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  53.83 
 
 		 636 aa  719    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  72.39 
 
 		 641 aa  966    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  72.4 
 
 		 644 aa  982    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  64.69 
 
 		 634 aa  827    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 640 aa  1317    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  54.53 
 
 		 635 aa  727    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  55.02 
 
 		 630 aa  733    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  71.88 
 
 		 641 aa  968    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  48.61 
 
 		 647 aa  658    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 		 635 aa  625  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 		 635 aa  621  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  47.19 
 
 		 635 aa  618  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  43.59 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  43.27 
 
 		 635 aa  538  1e-151  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  43.12 
 
 		 639 aa  529  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  40.44 
 
 		 646 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  35.39 
 
 		 636 aa  438  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 		 640 aa  433  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  37.34 
 
 		 634 aa  427  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  36.39 
 
 		 635 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 426 aa  267  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 422 aa  250  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 422 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 		 422 aa  249  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.69 
 
 		 543 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 468 aa  224  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.08 
 
 		 540 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.87 
 
 		 469 aa  220  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 570 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.84 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 468 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.45 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 460 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  32.14 
 
 		 468 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.92 
 
 		 467 aa  211  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 525 aa  210  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.08 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.99 
 
 		 524 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  31.08 
 
 		 467 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.44 
 
 		 536 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 		 473 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  32.06 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 830 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  30.27 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  30.67 
 
 		 467 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 461 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 466 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 455 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 455 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.17 
 
 		 464 aa  200  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  29.96 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 821 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  30.7 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  31.01 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.79 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  32.62 
 
 		 455 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 515 aa  198  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.23 
 
 		 530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  30.72 
 
 		 453 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 452 aa  197  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 481 aa  195  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.09 
 
 		 467 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.34 
 
 		 466 aa  194  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 		 536 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 463 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 433 aa  193  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 432 aa  193  8e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 467 aa  193  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>