274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2716 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
481 aa  999    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  65.15 
 
 
473 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  49.9 
 
 
461 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.4 
 
 
451 aa  455  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 
465 aa  359  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  38.11 
 
 
467 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 
466 aa  329  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.12 
 
 
540 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  35.99 
 
 
469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.93 
 
 
543 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.39 
 
 
541 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.64 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  36.74 
 
 
470 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  35.97 
 
 
465 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  35.58 
 
 
468 aa  300  5e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
525 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 
468 aa  297  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  36.1 
 
 
469 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 
522 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  36.16 
 
 
470 aa  291  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  33.89 
 
 
465 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  35.11 
 
 
467 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.74 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.82 
 
 
525 aa  289  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.28 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
464 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 
524 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
476 aa  280  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 
460 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 
535 aa  279  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
570 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 
463 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
462 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.74 
 
 
481 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.99 
 
 
464 aa  277  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 
462 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  34.02 
 
 
455 aa  276  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  34.33 
 
 
484 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
531 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 
544 aa  273  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
460 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.89 
 
 
460 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  35.55 
 
 
454 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 
465 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  33.4 
 
 
536 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 
461 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.04 
 
 
536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 
453 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
454 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
454 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  33.95 
 
 
467 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 
589 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  34.16 
 
 
467 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.92 
 
 
490 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 
472 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 
459 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
467 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 
472 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 
472 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  35.61 
 
 
603 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  34.99 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  35.39 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 
472 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.47 
 
 
454 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  33.54 
 
 
462 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 
454 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
462 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
465 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 
547 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.88 
 
 
468 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
536 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  32.78 
 
 
460 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 
478 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 
467 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  33.76 
 
 
489 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  33.26 
 
 
478 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  33.89 
 
 
467 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.23 
 
 
452 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.68 
 
 
467 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.75 
 
 
469 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.68 
 
 
480 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  31.26 
 
 
464 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  34.99 
 
 
455 aa  256  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  32.78 
 
 
515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.47 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.47 
 
 
480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
470 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.98 
 
 
455 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  34.58 
 
 
452 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  33.47 
 
 
452 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  30.44 
 
 
465 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.07 
 
 
471 aa  252  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  34.32 
 
 
540 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  33.19 
 
 
532 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
468 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
536 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>