More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3425 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 451 aa  929    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  47.47 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  47.4 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 		 464 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  38.13 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 		 466 aa  316  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.29 
 
 		 541 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.77 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 525 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 465 aa  289  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 524 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.03 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.82 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  35.46 
 
 		 469 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.55 
 
 		 525 aa  282  9e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 		 522 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.68 
 
 		 530 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  34.19 
 
 		 469 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 		 535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 464 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  34.54 
 
 		 455 aa  273  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 531 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  32.62 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  34.04 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.65 
 
 		 536 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  34.19 
 
 		 589 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 536 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  31.91 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  32.03 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 		 472 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 		 459 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 454 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 465 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  33.76 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.54 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.15 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  35.82 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 570 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 544 aa  262  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  33.47 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 542 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  32.77 
 
 		 484 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.4 
 
 		 464 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 		 468 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  33.26 
 
 		 452 aa  256  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 465 aa  255  9e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  32.48 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  33.12 
 
 		 467 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  33.05 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  34.44 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  32.25 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  33.41 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.05 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  32.91 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 461 aa  249  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 464 aa  249  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.05 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  31.83 
 
 		 536 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  33.7 
 
 		 540 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  33.62 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>