More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1945 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1945  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 461 aa  948    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  49.9 
 
 		 481 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5620  beta-lactamase domain protein  47.99 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.62 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  40.9 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  40.56 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 		 464 aa  342  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  37.58 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.24 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 		 470 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.85 
 
 		 540 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  36.85 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.45 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.02 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  38.61 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.08 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.71 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.47 
 
 		 530 aa  299  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 		 468 aa  299  8e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.34 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 		 468 aa  292  8e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  35.61 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 		 465 aa  289  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  35.34 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 		 454 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  36.3 
 
 		 462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 524 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  37.37 
 
 		 452 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  32.4 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  32.4 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 536 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.41 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.92 
 
 		 465 aa  279  6e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  34.33 
 
 		 467 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 463 aa  279  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  34.54 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 		 515 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1402  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 525 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.91 
 
 		 464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 536 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  34.77 
 
 		 462 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  36.32 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 544 aa  272  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.27 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  33.41 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  35.97 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  33.83 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  34.05 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  33.83 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  33.83 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  33.83 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  34.05 
 
 		 603 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 547 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  34.66 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  36.01 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  34.14 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  34.62 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  33.56 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  35.79 
 
 		 452 aa  263  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.67 
 
 		 455 aa  262  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.32 
 
 		 471 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.68 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.97 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  34.75 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  33.54 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.54 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.66 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 464 aa  260  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.04 
 
 		 470 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.97 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.05 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  33.48 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  33.12 
 
 		 467 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>